Dalam waktu 2 tahun ini diberikan kesempatan bagi para alumni program M.A. atau M.Div untuk melanjutkan ke jenjang program Magister Teologi melalui proses penyesuaian. Matakuliah yang telah diambil dari program M.A. atau M.Div dapat ditransfer ke program M.Th. ini, sehingga para alumni dituntut sekitar 18 SKS untuk matakuliah wajib dan menulis sebuah thesis/skripsi (6 SKS). Perkuliahan akan diadakan pada Senin-Selasa dan kuliah padat.
Besar harapan kami bahwa para alumni dapat menggunakan kesempatan baik ini. Bagi para alumni yang berminat dapat menghubungi Pdt. Sia Kok Sin sebagai ketua Program Studi S-2 dengan email koksinsia@yahoo.com atau 0816530480.
Adapun program penyesuaian ini sudah dilaksanakan mulai semester genap 2012/2013. Adapun biaya studi program ini adalah:
1. Biaya Pendaftaran : Rp. 200.000,-
2. Biaya Kuliah : Rp. 500.000,- per mata kuliah (3 SKS)
3. Biaya Administrasi Perpustakaan : Rp. 200.000,- per semester
4. Biaya Bimbingan Tesis : Rp. 750.000,- per semester
5. Biaya Wisuda : Rp. 500.000,-
Bagi yang berminat segera mendaftar paling lambat tanggal 22 Juni 2013