Pada tanggal 21-24 Juni 2016 Prodi Magister Theologi STT Aletheia Lawang juga mengadakan Kuliah Khusus Metode Penelitian dengan Pdt. Dr. Agung Gunawan, Th.M sebagai dosennya.

Kuliah ini dikhususkan bagi mahasiswa-mahasiswa S2 yang akan menempuh Ujian Proposal Tesis sehingga para mahasiswa yang mengikuti siap untuk menyusun tesisnya.

Dan pada tanggal 28 Juni 2016 diadakan Ujian Proposal Tesis dengan peserta yang dapat diakses di  http://akademik.sttaletheia.ac.id/?page_id=2142 dengan hasil yang menggembirakan karena semua mahasiswa yang mengikuti Ujian Proposal Tesis dinyatakan lulus dengan berbagai perubahan judul tesis.